В рамках СРПФР функционируют:
- Секретариат
- 3 рабочих группы:
- Международный центр оценки рисков отмывания денег и финансирования терроризма» (МЦОР)
- Сервис "Прозрачный блокчейн"
Решением Совета глав правительств СНГ от 30 октября 2015 года (г. Душанбе) Автономной некоммерческой организации «Международный учебно-методический центр финансового мониторинга» (Российская Федерация, г. Москва) придан статус базовой организации государств – участников СНГ по образованию в сфере противодействия ОД/ФТ и утверждено соответствующее Положение о базовой организации.